云南神农农业产业集团股份有限公司的主营业务是饲料加工和销售、生猪养殖和销售、生猪屠宰和生鲜猪肉食品销售、以及食品深加工和销售业务。公司的主要产品是饲料、生猪（商品猪、仔猪、种猪等）、生鲜猪肉（主要为白条猪肉）和猪副产品（猪头、内脏等）、猪肉深加工产品（小酥肉、午餐肉、肉肠等）等，此外还对外提供生猪屠宰服务。公司自主研发的“云南神农农业产业集团股份有限公司养殖系统”和“云南神农农业产业集团股份有限公司屠宰与结算系统”均已取得计算机软件著作权。